Đến nay, sau gần 20 năm đi vào hoạt động, Bảo tàng Yên Bái không chỉ khẳng định được vai trò quan trọng sự nghiệp bảo tồn và phát huy các di sản văn hóa của dân tộc mà còn góp phần tích cực vào công tác giáo dục truyền thống lịch sử – văn hóa cho các thế hệ hôm nay.

Hiện tại, Bảo tàng tỉnh đang lưu giữ  trên 20 ngàn di vật có giá trị, trong đó có nhiều sưu tập và hiện vật cổ vô cùng quý giá, phản ảnh mọi thời kỳ của lịch sử, như: di vật thời đại đá cũ có niên đại cách ngày nay 1,3 vạn năm; sưu tập hậu kỳ đá mới sơ kỳ kim khí cách ngày nay 3-5 nghìn năm; sưu tập văn hóa Đông Sơn cách ngày nay trên 2.000 năm… tất cả hiện đều đang được bảo quản an toàn theo quy định, sẵn sàng phục vụ công tác trưng bày và nghiên cứu khoa học.